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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

苏贞昌为挡“小三通”抛“大陆抢药说”，被台胞批“为难台湾民众”******

　　【环球网报道】据台湾中时新闻网报道，台湾加工类食品、水产品因注册问题被大陆暂停输入，加上“小三通”未恢复，金门县“立委”陈玉珍、准金门县长陈福海、准“连江县长”王忠铭日前率团赴大陆沟通。台“行政院长”苏贞昌却宣称，“小三通”重启恐让大陆民众来台抢药造成防疫破口。对此，有生活在大陆的台胞称，大陆还没开放民众赴台自由行，“小三通”往返两岸的大部分还是台湾人，批评苏贞昌是在为难台湾民众。

　　“不知道苏贞昌是傻还是坏”，居住在厦门多年的台胞符先生表示，台湾现在没有开放大陆的旅行团入境，大陆也没有开放民众到台湾的自由行，剩下的就是探亲以及商务的大陆民众会往返两岸。

　　符先生说，通过“小三通”往返两岸的几乎都是台湾民众，大陆人数量极少，苏贞昌“对岸抢药”的抹黑与谎言，根本是在为难台湾民众。

　　报道称，在苏州工作10多年的李姓台商称，台湾的进口药品确实比大陆便宜，但和抢药根本两回事，一个“行政院长”竟然用大陆人会来台湾抢药的说法带动“抗中保台”的情绪，民进党在“九合一”败选后仍继续以“抗中保台”造成两岸更加对立，真是离谱至极。

　　疫情暴发后，台湾方面于2020年2月10日关闭“小三通”，至今已经快3年。随着岛内边境解封，台商和金马地区民众希望恢复“小三通”的声音越来越强烈。

　　就在各界都对“小三通”复航充满期待之际，苏贞昌又浇了一盆冷水。他12日在出席活动时称，任何人都不能因个人立场妨碍全台一致的防疫作业，希望大家都能以民众健康为重、社会安定为念，如果轻率地不管疫情，随便大开边境，过去大陆人到香港去抢药的情况，大家都看见了，“对岸现在受疫情影响，若台湾因为开放边境而造成防疫破口，妨碍台湾近3年的防疫成功，对民众的健康不能交代，因此没有道理现在要开放小三通”。

　　台媒分析称，蔡英文当局事实上尚未开放大陆民众赴台观光，仅允许商务、探亲与奔丧申请入境，大陆也尚未开放大陆民众出境旅游，仅能申请留学、商务或工作。也就是说，两岸旅游仍受管制，苏贞昌竟说“小三通若开，恐让对岸民众来台抢药”，是在刻意带风向。

　　(来源：环球网)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）